Onemocnění způsobující mutace versus neutrálnípolymorfizmus: využití bioinformatiky v DNAdiagnostice

Overview

V současné době prudce narůstá množství identifikovaných genů, které jsou-li poškozeny nebo je-li změněna jejichfunkce či regulační vztahy způsobují dědičnou predispozici k určitému onemocnění. Molekulárně genetická diagnostikaje nyní dostupnou součástí vyšetření u řady geneticky podmíněných chorob. Laboratorní metody umožňujídetekci široké škály mutací, které lze obecně definovat jako odchylky od specifické DNA sekvence ve srovnánís referenční sekvencí zveřejněnou v genové databázi. V některých případech je však obtížné rozlišit, zda je detekovanásekvenční varianta hledanou onemocnění způsobující mutací nebo zda se jedná o neutrální (polymorfní) variantunemající vztah k onemocnění jedince. Dědičné formy komplexních onemocnění, jako jsou například hereditárníformy nádorových onemocnění, jsou z hlediska interpretace závažnosti mutace velmi problematickou skupinou.Další analýzy na DNA a na proteinové úrovni s využitím bioinformatiky však mohou míru patogenity sekvenčníchvariant nejasného významu odhalit. Určení konkrétní příčiny genetické predispozice k onemocnění a míra patogenityza onemocnění odpovědné mutace má význam pro včasný záchyt jedinců ve velkém riziku onemocnění, pro cílenápreventivní a léčebná opatření a umožňuje v závažných případech prenatální nebo případně také preimplantačnídiagnostiku.

Klíčová slova:
mutace, polymorfizmus, bioinformatika, predikční program, databáze.