Současný průkaz DNA Chlamydia pneumoniae a Chlamydia trachomatis pomocí real-time PCR
Authors:
K. Roubalová
Authors‘ workplace:
NRL pro chlamydie, Centrum epidemiologie a mikrobiologie, Státní zdravotní ústav, Praha
Published in:
Epidemiol. Mikrobiol. Imunol. 56, 2007, č. 4, s. 166-173
Overview
Cíl práce:
Navržení a validace real-time PCR, vhodné pro kvantitativní průkaz C. pneumoniae a C. trachomatis v klinických vzorcích.
Materiál a metody:
Jako cílový úsek pro amplifikaci byla zvolena část genu pro 16S RNA. Pomocí klonování produktu reakce v bakteriálním plazmidu byl připraven rekombinantní kalibrátor a kombinovaný interní standard, který lze použít ve třech různých PCR. Pro validaci byly použity archivované izoláty DNA z různých klinických vzorků, izoláty DNA z dalších infekčních agens a kontrolní vzorky pro detekci DNA CT (QCMD) a CPN (Instand).
Výsledky:
Byla ověřena specificita a reprodukovatelnost reakce. Analytická citlivost byla stanovena na 5–10 kopií bakteriálního genomu/reakci. 105 izolátů DNA z různých typů klinických vzorků (výtěry, moče, periferní krev, BAL) bylo vyšetřeno pomocí real-time PCR a konvenční PCR. Vzorky, které poskytly nesouhlasný výsledek, byly charakterizovány pomocí třetího nezávislého amplifikačního testu. Citlivost a specificita real-time PCR byla 89 % a 100 %. Metoda je vhodná pro screening i diagnostiku chlamydií.
Klíčová slova:
Chlamydia pneumoniae – Chlamydia trachomatis – diagnostika – real-time PCR.
Labels
Hygiene and epidemiology Medical virology Clinical microbiologyArticle was published in
Epidemiology, Microbiology, Immunology
![Issue 4](https://www.prolekare.cz/media/cache/resolve/journal_issue/media/image_pdf/7a6b11adccb61d68071170e0a0265f4f.jpeg)
2007 Issue 4
Most read in this issue
- Klinicky významné β-laktamázy gramnegativních bakterií: AmpC
- Babesióza, málo známá zoonóza
- Současný průkaz DNA Chlamydia pneumoniae a Chlamydia trachomatis pomocí real-time PCR
- Epidemiologie metabolického syndromu a možnosti prevence pohybovou aktivitou